Bidomene-modellen

Bidomene-modellen er en matematisk modell av hjertemuskelens elektriske egenskaper. Den er en kontinuumsmodell basert på forskjeller mellom det ekstracellulære og instracellulære domenet – området på innsiden av og på utsiden av muskelceller – der hver av disse er antatt å eksistere overalt, definert ut fra et lokalt gjennomsnitt. Bidomene-modellen er formulert som et ligningssett, bidomene-ligningene, som sammen med gitte randbetingelser kan løses i et gitt domene.

Bidomene-modellen ble utviklet på slutten av 1970-tallet, første gang presentert av Leslie Tung i januar 1978.[1][2] Den brukes i dag blant annet til å modellere defibrillering av hjertet.[3]

Grunnlag

Hjertemuskelen består av muskelceller, der man regner området som er på innsiden av disse som det intracellulære området og området som er rundt, utenfor, som det ekstracellulære området. I bidomene-modellen antar man at disse eksisterer overalt, og at hvert punkt i et gitt domene har egenskaper som tilhører hvert av disse. Som vanlig i kontinuumsmodeller er disse egenskapene basert på gjennomsnittsverdier i et lite område rundt et gitt punkt i domenet.[2]

Spenningsforskjell i det ekstracellulære og det intracellulære området, membranpotensialet, karakteriserer alle muskelceller. Dette er vesentlig for hjertet og dets funksjonalitet. Bidomene-modellen kobler sammen ligninger som beskriver et legemets elektriske egenskaper generelt, og ligninger som karakteriserer denne forskjellen.[1]

Muskelfibrene i hjertet er organisert i lag der hvert lag består av «rør» av sarkomerer. Disse er lokalt velorganisert og går i samme retning. Man kan derfor lokalt definere tre vektorer som henholdsvis angir retningen disse går i, retningen på tvers (men i samme lag) og normalen av disse, som vil være på hvers av lagene.[4] Konduktansverdiene til hjertevevet avhenger av denne retningen, og antas å være sterkest i samme retning som muskelfibrene, dernest kommer på tvers av disse og minst i retning av normalen. Den er videre ulik i det ekstracellulære og det intracellulære området.[2]

Matematisk modell

Standardformulering

Bidomene-ligningene er gitt ved

( M i v ) + ( ( M i + M e ) v e ) = 0 ( M i v ) + ( M i v e ) = χ ( C m v t + I i o n ) {\displaystyle {\begin{alignedat}{2}\nabla \cdot \left(M_{i}\nabla v\right)+\nabla \cdot \left(\left(M_{i}+M_{e}\right)\nabla v_{e}\right)&=0\\\nabla \cdot \left(M_{i}\nabla v\right)+\nabla \cdot \left(M_{i}\nabla v_{e}\right)&=\chi \left(C_{m}{\frac {\partial v}{\partial t}}+I_{\mathrm {ion} }\right)\end{alignedat}}}

der χ {\displaystyle \chi } angir cellemembranens overflateareal, per enhetsvolum, C m {\displaystyle C_{m}} cellemembranens elektriske kapasitans per enhetsareal, v = v i v e {\displaystyle v=v_{i}-v_{e}} er v i {\displaystyle v_{i}} den intracellulære spenningen og v e {\displaystyle v_{e}} den ekstracellulære spenningen, og I i o n {\displaystyle I_{\mathrm {ion} }} ionestrømmen over membranen per enhetsareal.[2]

Sammen med gitte randbetingelser kan man løse disse ligningene over et gitt domene numerisk.[2]

Utledning

La Ω {\displaystyle \Omega } med rand Ω {\displaystyle \partial \Omega } betegne alle punkter x {\displaystyle x} i hjertet. I hvert punkt i Ω {\displaystyle \Omega } kan vi definere en intra- og ekstracellulær spenning, samt en intra- og ekstracellulær strøm, kalt henholdsvis v i {\displaystyle v_{i}} , v e {\displaystyle v_{e}} , J i {\displaystyle J_{i}} og J e {\displaystyle J_{e}} . Konduktansen i det intra- og ekstracellulære domenet er videre gitt ved M i {\displaystyle M_{i}} og M e {\displaystyle M_{e}} .

Vi antar at forholdet mellom strøm, spenning og konduktans er gitt ved Ohms lov, hvilket gir

J i = M i v i J e = M e v e . {\displaystyle {\begin{alignedat}{2}J_{i}&=-M_{i}\nabla v_{i}\\J_{e}&=-M_{e}\nabla v_{e}.\end{alignedat}}}

Vi antar at ladning ikke akkumuleres i noe enkeltpunkt i Ω {\displaystyle \Omega } – så total ladning er alltid bevart – hvilket gir

( J i + J e ) = 0 {\displaystyle \nabla \cdot \left(J_{i}+J_{e}\right)=0}

som ved ligningene over kan skrives om til

( M i v i ) + ( M e v e ) = 0 {\displaystyle \nabla \cdot \left(M_{i}\nabla v_{i}\right)+\nabla \cdot \left(M_{e}\nabla v_{e}\right)=0}

Denne ligningen sier at all strøm som går ut fra ett domene (enten det ekstracellulære eller det intracellulære) må gå inn i det andre.[2]

Man kan anta at transmembranpotensialet, definert som v = v i v e {\displaystyle v=v_{i}-v_{e}} , er relatert til spenningsforskjellen ved

v = q i q e 2 χ C m {\displaystyle v={\frac {q_{i}-q_{e}}{2\chi C_{m}}}}

der q i {\displaystyle q_{i}} og q e {\displaystyle q_{e}} angir intra- og ekstracellulær ladning, χ {\displaystyle \chi } angir overflateareal per enhetsvolum og C m {\displaystyle C_{m}} cellemembranens kapasitans. Videre tar vi den tidsderiverte av dette, og antar vi at strømmen inn og ut av hvert domene er bevart. Fra dette kan vi utlede at

J t = χ ( C m v t + I i o n ) {\displaystyle J_{t}=\chi \left(C_{m}{\frac {\partial v}{\partial t}}+I_{\mathrm {ion} }\right)}

hvilket kombinert gir

( M i v ) + ( M i v e ) = χ ( C m v t + I i o n ) . {\displaystyle \nabla \cdot \left(M_{i}\nabla v\right)+\nabla \cdot \left(M_{i}\nabla v_{e}\right)=\chi \left(C_{m}{\frac {\partial v}{\partial t}}+I_{\mathrm {ion} }\right).}

som er den andre bidomene-ligningen.[2]

Konduktansverdier

Konduktansverdiene i henholdsvis samme retning som fibrene, på tvers av disse og normalt på hvert lag er ulik; videre er disse igjen ulike i det intracellulære og ekstracellulære området. Dette kan modelleres ved hjelp av diagonale matriser (annengrads tensorer), der konduktivitetsverdiene lokalt er angitt ved

M i = [ σ f i 0 0 0 σ t i 0 0 0 σ n i ] M e = [ σ f e 0 0 0 σ t e 0 0 0 σ n e ] {\displaystyle M_{i}={\begin{bmatrix}\sigma _{fi}&0&0\\0&\sigma _{ti}&0\\0&0&\sigma _{ni}\end{bmatrix}}\qquad M_{e}={\begin{bmatrix}\sigma _{fe}&0&0\\0&\sigma _{te}&0\\0&0&\sigma _{ne}\end{bmatrix}}} ,

der σ i j {\displaystyle \sigma _{ij}} angir konduktivitetverdi i henholdsvis retning e f , e t , e n {\displaystyle \mathbf {e_{f}} ,\mathbf {e_{t}} ,\mathbf {e_{n}} } (i retning fibrene, på tvers, normalt) for j i , e {\displaystyle j\in {i,e}} (intracellulært, ekstracellulært).[2] Dette er lokale verdier som må omregnes til globale verdier ut fra vektorfeltet som definerer fibrenes geometri i et gitt punkt.

Disse verdiene er skalare estimerte verdier, og ikke gitt direkte i originalformuleringen av bidomene-modellen. Forskning på dette antyder at forholdet mellom verdiene er gitt ved 4:2:1, men ulike artikler oppgir ulike konduktansverdier.[5]

Ved å anta at konduktansverdiene er proporsjonale i det intra- og ekstracellulære domenet, altså at M i = λ M e {\displaystyle M_{i}=\lambda M_{e}} for en skalarverdi λ {\displaystyle \lambda } , kan modellen reduseres til monodomene-modellen.[2]

Randbetingelser

For å finne en løsning for ligningssettet over, må man angi randbetingelser.[2] Dersom man antar at domenet er omgitt av et isolerende medium, kan man modellere dette som

n J i = 0 n J e = 0 {\displaystyle n\cdot J_{i}=0\qquad n\cdot J_{e}=0}

der n er overflatens normalvektor, og ligningene angir at henholdsvis at den intracellulære og ekstracellulære strømmen er null på randen. Ved å bruke ligningene over kan dette skrives om til[2]

n ( M i v + M i v e ) = 0 n ( M e v e ) = 0 {\displaystyle n\cdot (M_{i}\nabla v+M_{i}\nabla v_{e})=0\qquad n\cdot (M_{e}\nabla v_{e})=0}

Referanser

  1. ^ a b Leslie Tung (Januar 1978). «A bi-domain model for describing ischemic myocardial d-c potentials». 
  2. ^ a b c d e f g h i j k Joakim Sundnes, Glenn Terje Lines, Xing Cai, Bjørn Fredrik Nielsen, Kent-Andre Mardal, Aslak Tveito (2006). Computing the Electrical Activity in the Heart. New York: Springer. s. 25–30. ISBN 978-3-540-33432-3. 
  3. ^ Natalia Trayanova, Jason Constantino, Takashi Ashihara, Gernot Plank. «Modeling Defibrillation of the Heart: Approaches and Insights». IEEE. doi:10.1109/RBME.2011.2173761. CS1-vedlikehold: Flere navn: forfatterliste (link)
  4. ^ Shoba Ranganathan, Kenta Nakai, Christian Schonbac, red. (2018). Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology: ABC of Bioinformatics. s. 903. ISBN 9780128114148. CS1-vedlikehold: Flere navn: redaktørliste (link)
  5. ^ Barbara M. Johnston. «Six Conductivity Values to Use in the Bidomain Model of Cardiac Tissue». IEEE Transactions on Biomedical Engineering. doi:10.1109/TBME.2015.2498144. 

Eksterne lenker

  • Artikkel om bidomene-modellen på Scholarpedia
Autoritetsdata