CCL20

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JYO, 1M8A, 2HCI

Ідентифікатори

Символи

CCL20, CKb4, Exodus, LARC, MIP-3-alpha, MIP-3a, MIP3A, SCYA20, ST38, chemokine (C-C motif) ligand 20, C-C motif chemokine ligand 20

Зовнішні ІД

OMIM: 601960 MGI: 1329031 HomoloGene: 3375 GeneCards: CCL20

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CCR6 chemokine receptor binding • chemokine activity • CCR chemokine receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • внутрішньоклітинний • міжклітинний простір
Біологічний процес	• monocyte chemotaxis • positive regulation of T cell migration • neutrophil chemotaxis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • defense response to bacterium • cell-cell signaling • lymphocyte chemotaxis • Загоєння ран • cellular response to lipoteichoic acid • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to organic substance • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to interleukin-1 • cellular response to interferon-gamma • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to lipopolysaccharide • хемотаксис • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • cell chemotaxis • T cell migration • thymocyte migration • inflammatory response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6364


20297

Ensembl


ENSG00000115009


ENSMUSG00000026166

UniProt


P78556


O89093

RefSeq (мРНК)


NM_004591 NM_001130046


NM_001159738 NM_016960

RefSeq (білок)


NP_001123518 NP_004582


NP_001153210 NP_058656

Локус (UCSC)

Хр. 2: 227.81 – 227.82 Mb

Хр. 1: 83.09 – 83.1 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCL20 (англ. C-C motif chemokine ligand 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 96 амінокислот, а молекулярна маса — 10 762^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCCTKSLLLA		ALMSVLLLHL		CGESEAASNF		DCCLGYTDRI		LHPKFIVGFT
RQLANEGCDI		NAIIFHTKKK		LSVCANPKQT		WVKYIVRLLS		KKVKNM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, антибіотиків, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як запальна відповідь, хемотаксис, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Roehrl J., Yang D., Oppenheim J.J., Hehlgans T. (2010). Specific binding and chemotactic activity of mBD4 and its functional orthologue hBD2 to CCR6-expressing cells. J. Biol. Chem. 285: 7028—7034. PMID 20068036 DOI:10.1074/jbc.M109.091090
Ito T., Carson W.F. IV, Cavassani K.A., Connett J.M., Kunkel S.L. (2011). CCR6 as a mediator of immunity in the lung and gut. Exp. Cell Res. 317: 613—619. PMID 21376174 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.12.018
Rossi D.L., Vicari A.P., Franz-Bacon K., McClanahan T.K., Zlotnik A. (1997). Identification through bioinformatics of two new macrophage proinflammatory human chemokines: MIP-3alpha and MIP-3beta. J. Immunol. 158: 1033—1036. PMID 9013939

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10619 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P78556 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.