PHF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3KQI, 3PTR, 3PU3, 3PU8, 3PUA, 3PUS

Ідентифікатори

Символи

PHF2, CENP-35, GRC5, JHDM1E, PHD finger protein 2, KDM7C

Зовнішні ІД

OMIM: 604351 MGI: 1338034 HomoloGene: 3934 GeneCards: PHF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding • histone H3-methyl-lysine-9 demethylase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • histone demethylase activity • zinc ion binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • хромосома • ядерце • центромера • кінетохор • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K9 demethylation • protein demethylation • transcription, DNA-templated • negative regulation of ribosomal DNA heterochromatin assembly • liver development • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5253


18676

Ensembl


ENSG00000197724


ENSMUSG00000038025

UniProt


O75151


Q9WTU0

RefSeq (мРНК)


NM_005392 NM_024517


NM_011078

RefSeq (білок)


NP_005383


NP_035208

Локус (UCSC)

Хр. 9: 93.58 – 93.68 Mb

Хр. 13: 48.96 – 49.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PHF2 (англ. PHD finger protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 096 амінокислот, а молекулярна маса — 120 775^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATVPVYCVC	RLPYDVTRFM	IECDACKDWF	HGSCVGVEEE	EAPDIDIYHC
PNCEKTHGKS	TLKKKRTWHK	HGPGQAPDVK	PVQNGSQLFI	KELRSRTFPS
AEDVVARVPG	SQLTLGYMEE	HGFTEPILVP	KKDGLGLAVP	APTFYVSDVE
NYVGPERSVD	VTDVTKQKDC	KMKLKEFVDY	YYSTNRKRVL	NVTNLEFSDT
RMSSFVEPPD	IVKKLSWVEN	YWPDDALLAK	PKVTKYCLIC	VKDSYTDFHI
DSGGASAWYH	VLKGEKTFYL	IRPASANISL	YERWRSASNH	SEMFFADQVD
KCYKCIVKQG	QTLFIPSGWI	YATLTPVDCL	AFAGHFLHSL	SVEMQMRAYE
VERRLKLGSL	TQFPNFETAC	WYMGKHLLEA	FKGSHKSGKQ	LPPHLVQGAK
ILNGAFRSWT	KKQALAEHED	ELPEHFKPSQ	LIKDLAKEIR	LSENASKAVR
PEVNTVASSD	EVCDGDREKE	EPPSPIEATP	PQSLLEKVSK	KKTPKTVKMP
KPSKIPKPPK	PPKPPRPPKT	LKLKDGGKKK	GKKSRESASP	TIPNLDLLEA
HTKEALTKME	PPKKGKATKS	VLSVPNKDVV	HMQNDVERLE	IREQTKSKSE
AKWKYKNSKP	DSLLKMEEEQ	KLEKSPLAGN	KDNKFSFSFS	NKKLLGSKAL
RPPTSPGVFG	ALQNFKEDKP	KPVRDEYEYV	SDDGELKIDE	FPIRRKKNAP
KRDLSFLLDK	KAVLPTPVTK	PKLDSAAYKS	DDSSDEGSLH	IDTDTKPGRN
ARVKKESGSS	AAGILDLLQA	SEEVGALEYN	PSSQPPASPS	TQEAIQGMLS
MANLQASDSC	LQTTWGAGQA	KGSSLAAHGA	RKNGGGSGKS	AGKRLLKRAA
KNSVDLDDYE	EEQDHLDACF	KDSDYVYPSL	ESDEDNPIFK	SRSKKRKGSD
DAPYSPTARV	GPSVPRQDRP	VREGTRVASI	ETGLAAAAAK	LSQQEEQKSK
KKKSAKRKLT	PNTTSPSTST	SISAGTTSTS	TTPASTTPAS	TTPASTSTAS
SQASQEGSSP	EPPPESHSSS	LADHEYTAAG	TFTGAQAGRT	SQPMAPGVFL
TQRRPSASSP	NNNTAAKGKR	TKKGMATAKQ	RLGKILKIHR	NGKLLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

Horton J.R., Upadhyay A.K., Hashimoto H., Zhang X., Cheng X. (2011). Structural basis for human PHF2 Jumonji domain interaction with metal ions. J. Mol. Biol. 406: 1—8. PMID 21167174 DOI:10.1016/j.jmb.2010.12.013

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8920 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O75151 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.