PTPRM

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1RPM, 2C9A, 2V5Y

Ідентифікатори

Символи

PTPRM, PTPRL1, R-PTP-MU, RPTPM, RPTPU, hR-PTPu, protein tyrosine phosphatase, receptor type M, protein tyrosine phosphatase receptor type M

Зовнішні ІД

OMIM: 176888 MGI: 102694 HomoloGene: 37694 GeneCards: PTPRM

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • integral component of plasma membrane • perinuclear region of cytoplasm • lamellipodium • клітинна мембрана
Біологічний процес	• GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • retina layer formation • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of endothelial cell migration • negative regulation of endothelial cell proliferation • адгезія клітин • negative regulation of angiogenesis • neuron projection development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • retinal ganglion cell axon guidance • peptidyl-tyrosine dephosphorylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5797


19274

Ensembl


ENSG00000173482


ENSMUSG00000033278

UniProt


P28827


P28828

RefSeq (мРНК)

NM_001105244 NM_002845 NM_001378142 NM_001378143 NM_001378144
NM_001378145 NM_001378146 NM_001378147


NM_008984 NM_001357625

RefSeq (білок)

NP_001098714 NP_002836 NP_001365071 NP_001365072 NP_001365073
NP_001365074 NP_001365075 NP_001365076


NP_033010 NP_001344554

Локус (UCSC)

Хр. 18: 7.57 – 8.41 Mb

Хр. 17: 66.97 – 67.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTPRM (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 452 амінокислот, а молекулярна маса — 163 682^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRGLGTCLAT	LAGLLLTAAG	ETFSGGCLFD	EPYSTCGYSQ	SEGDDFNWEQ
VNTLTKPTSD	PWMPSGSFML	VNASGRPEGQ	RAHLLLPQLK	ENDTHCIDFH
YFVSSKSNSP	PGLLNVYVKV	NNGPLGNPIW	NISGDPTRTW	NRAELAISTF
WPNFYQVIFE	VITSGHQGYL	AIDEVKVLGH	PCTRTPHFLR	IQNVEVNAGQ
FATFQCSAIG	RTVAGDRLWL	QGIDVRDAPL	KEIKVTSSRR	FIASFNVVNT
TKRDAGKYRC	MIRTEGGVGI	SNYAELVVKE	PPVPIAPPQL	ASVGATYLWI
QLNANSINGD	GPIVAREVEY	CTASGSWNDR	QPVDSTSYKI	GHLDPDTEYE
ISVLLTRPGE	GGTGSPGPAL	RTRTKCADPM	RGPRKLEVVE	VKSRQITIRW
EPFGYNVTRC	HSYNLTVHYC	YQVGGQEQVR	EEVSWDTENS	HPQHTITNLS
PYTNVSVKLI	LMNPEGRKES	QELIVQTDED	LPGAVPTESI	QGSTFEEKIF
LQWREPTQTY	GVITLYEITY	KAVSSFDPEI	DLSNQSGRVS	KLGNETHFLF
FGLYPGTTYS	FTIRASTAKG	FGPPATNQFT	TKISAPSMPA	YELETPLNQT
DNTVTVMLKP	AHSRGAPVSV	YQIVVEEERP	RRTKKTTEIL	KCYPVPIHFQ
NASLLNSQYY	FAAEFPADSL	QAAQPFTIGD	NKTYNGYWNT	PLLPYKSYRI
YFQAASRANG	ETKIDCVQVA	TKGAATPKPV	PEPEKQTDHT	VKIAGVIAGI
LLFVIIFLGV	VLVMKKRKLA	KKRKETMSST	RQEMTVMVNS	MDKSYAEQGT
NCDEAFSFMD	THNLNGRSVS	SPSSFTMKTN	TLSTSVPNSY	YPDETHTMAS
DTSSLVQSHT	YKKREPADVP	YQTGQLHPAI	RVADLLQHIT	QMKCAEGYGF
KEEYESFFEG	QSAPWDSAKK	DENRMKNRYG	NIIAYDHSRV	RLQTIEGDTN
SDYINGNYID	GYHRPNHYIA	TQGPMQETIY	DFWRMVWHEN	TASIIMVTNL
VEVGRVKCCK	YWPDDTEIYK	DIKVTLIETE	LLAEYVIRTF	AVEKRGVHEI
REIRQFHFTG	WPDHGVPYHA	TGLLGFVRQV	KSKSPPSAGP	LVVHCSAGAG
RTGCFIVIDI	MLDMAEREGV	VDIYNCVREL	RSRRVNMVQT	EEQYVFIHDA
ILEACLCGDT	SVPASQVRSL	YYDMNKLDPQ	TNSSQIKEEF	RTLNMVTPTL
RVEDCSIALL	PRNHEKNRCM	DILPPDRCLP	FLITIDGESS	NYINAALMDS
YKQPSAFIVT	QHPLPNTVKD	FWRLVLDYHC	TSVVMLNDVD	PAQLCPQYWP
ENGVHRHGPI	QVEFVSADLE	EDIISRIFRI	YNAARPQDGY	RMVQQFQFLG
WPMYRDTPVS	KRSFLKLIRQ	VDKWQEEYNG	GEGRTVVHCL	NGGGRSGTFC
AISIVCEMLR	HQRTVDVFHA	VKTLRNNKPN	MVDLLDQYKF	CYEVALEYLN
SG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hoffmann K.M., Tonks N.K., Barford D. (1997). The crystal structure of domain 1 of receptor protein-tyrosine phosphatase mu. J. Biol. Chem. 272: 27505—27508. PMID 9346878 DOI:10.1074/jbc.272.44.27505

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9675 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P28827 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.